Materiały konferencyjne SEP 2026

Analiza mikrobiomu – podejście nienadzorowane Mikrobiom gleb pogórniczych stanowi kluczowy, lecz słabo poznany element novel ecosystems. Algorytmy grupowania bez nadzoru pozwalają identyfikować naturalne klastry społeczności mikrobiologicznych bez a priori zdefiniowanych kategorii. k-means clustering Partycjonowanie próbek mikrobiologicznych (OTU, metagenomy) na grupy o minimalizowanej wariancji wewnątrzklastrowej DBSCAN Detekcja klastrów o nieregularnym kształcie i identyfikacja anomalii – próbek mikrobiologicznie unikalnych PCA / t-SNE / UMAP Redukcja wymiarowości danych metagenomicznych do interpretowalnych reprezentacji 2D/3D Odkryte zależności Grupowanie próbek ujawnia, że mikrobiom podąża za gradientem pH i stężeń metali – tworzą się wyraźne gildie funkcjonalne dostosowane do lokalnych warunków geochemicznych. Metody nienadzorowane nie wymagają wstępnej wiedzy o liczbie ani charakterze grup – umożliwiają odkrywanie nowych zależności w danych metagenomicznych